1.使用過程中的清洗
純水機首次使用應進行沖洗，以沖掉純水機內的保護液。將自來水龍頭、自來水進水球閥、凈化水龍頭全部打開，沖洗15分鐘直到產水清澈無泡沫為止。沖洗過程中頻繁的開關自來水龍頭（關3秒、開10秒）使水流形成脈動式的沖擊，會使沖洗效果更好。之后關閉排污水龍頭，打開凈化水龍頭，制水5分鐘后正常使用。
經常順沖洗：在日常使用自來水龍頭取水的過程也就是對凈水機進行了順沖洗，建議在取用凈化水后打開自來水龍頭沖洗一下，及時將截留的污染物沖走，保持凈水機較高的水通量，從而延長使用壽命。
反沖洗恢復產水量：如果凈水機通過順沖洗后產水量還比較小，則可以考慮對凈水機進行反沖洗。凈水機上一般有個反沖洗的按鈕，可以實現水流反向沖洗，以沖掉濾芯中的堵塞物。
當超過三天不使用純水機，再次使用時應對純水機先順沖洗2-5分鐘，直到純水機內的存水排盡為止；在自來水停水的情況下，先打開排污水龍頭將自來水管內的泥沙、鐵銹等排盡后，再打開凈化水龍頭使用凈水。
2.核心部件清洗方法
（1）用泵將干凈、無游離氯的反滲透產品水從清洗箱（或相應水源）打入壓力容器中并排放幾分鐘。
（2）用干凈的產品水在清洗箱中配制清洗液。
（3）將清洗液在壓力容器中循環1小時或預先設定的時間。
（4）清洗完成以后，排凈清洗箱并進行沖洗，然后向清洗箱中充滿干凈的產品水以備下一步沖洗。
（5）用泵將干凈、無游離氯的產品水從清洗箱（或相應水源）打入壓力容器中并排放幾分鐘。
（6）在沖洗反滲透系統后，在產品水排放閥打開狀態下運行反滲透系統，直到產品水清潔、無泡沫或無清洗劑（通常15~30分鐘）。
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